Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtbP41155 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtbP41155 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbP41155 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbP41155 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbP41155 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LtbP41155 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbP41155 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LtbP41155 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbP41155 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbP41155 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbP41155 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LtbP41155 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LtbP41155 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LtbP41155 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms