Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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