Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd1P40201 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd1P40201 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd1P40201 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms