Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr2cP34968 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr2cP34968 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms