Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptk2P34152 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms