Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms