Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms