Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms