Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VtnP29788 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VtnP29788 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VtnP29788 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms