Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprmP28828 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprmP28828 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprmP28828 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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