Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms