Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms