Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
U2af2P26369 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U2af2P26369 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms