Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms