Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra3P26049 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms