Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms