Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms