Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PparaP23204 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PparaP23204 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PparaP23204 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PparaP23204 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PparaP23204 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms