Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms