Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim1P20664 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms