Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcer1aP20489 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms