Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms