Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP20293 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP20293 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TP20293 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TP20293 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TP20293 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP20293 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP20293 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms