Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms