Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka3P18654 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms