Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsaP16675 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsaP16675 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsaP16675 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms