Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FlgP11088 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FlgP11088 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FlgP11088 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FlgP11088 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FlgP11088 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FlgP11088 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FlgP11088 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FlgP11088 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FlgP11088 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FlgP11088 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FlgP11088 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FlgP11088 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FlgP11088 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FlgP11088 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FlgP11088 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms