Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp28P10078 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms