Protein–RNA interactions for Protein: P0CG09

C2cd4d, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd4dP0CG09 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2cd4dP0CG09 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2cd4dP0CG09 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms