Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxa6P09092 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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