Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sod1P08228 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms