Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms