Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P04213 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04213 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04213 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04213 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04213 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04213 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04213 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04213 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04213 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04213 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms