Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01680 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01680 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01680 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01680 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01680 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01680 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01680 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01680 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01680 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01680 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01680 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01680 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms