Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01679 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01679 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01679 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01679 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01679 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01679 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01679 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01679 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01679 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01679 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms