Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01667 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01667 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01667 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01667 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01667 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01667 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01667 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01667 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01667 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01667 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01667 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01667 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01667 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms