Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01656 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01656 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01656 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01656 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01656 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01656 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01656 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms