Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01654 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01654 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01654 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01654 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01654 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01654 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01654 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms