Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01652 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01652 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01652 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01652 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01652 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01652 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01652 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01652 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01652 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01652 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01652 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01652 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms