Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lancl1O89112 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms