Protein–RNA interactions for Protein: O89009

Magea5, MCG115462, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea5O89009 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Magea5O89009 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Magea5O89009 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Magea5O89009 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Magea5O89009 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Magea5O89009 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Magea5O89009 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Magea5O89009 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Magea5O89009 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Magea5O89009 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Magea5O89009 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Magea5O89009 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Magea5O89009 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Magea5O89009 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Magea5O89009 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Magea5O89009 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Magea5O89009 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Magea5O89009 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Magea5O89009 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms