Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setdb1O88974 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Setdb1O88974 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setdb1O88974 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setdb1O88974 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Setdb1O88974 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setdb1O88974 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setdb1O88974 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setdb1O88974 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setdb1O88974 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms