Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms