Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms