Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms