Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmx1bO88609 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms