Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms