Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd46O88174 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms