Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp4O70480 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms