Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtssO70370 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtssO70370 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtssO70370 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtssO70370 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtssO70370 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtssO70370 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtssO70370 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms